Knjižara Beopolis je osnovana krajem 1999. godine kao rezultat dogovora o programskoj saradnji između dotadašnje izdavačke kuće Beopolis i Doma omladine Beograda.
Ubrzo Beopolis postaje kultna beogradska knjižara ponajpre zahvaljujući svom programskom opredeljenju da ponudi, pre svega, relevantne naslove iz oblasti humanistike, teorije umetnosti, stripa, kao i kvalitetna dela domaće (čitav jugoslovenski prostor) i prevedene književnosti. Knjižara Beopolis svoj status gradi i podrškom malim i nezavisnim te nekomercijalnim izdavačima.
Istovremeno Beopolis učestvuje, logistikom ili aktivno, i u organizaciji umetničkih festivala, tribina, promocija i javnih rasprava. Beopolis svoj društveni angažman odnedavno proširuje i potvrđuje svojom radio emisijom „Beopolis iz RadioAparata“ koja se emituje na RadioAparat web radiju.
Knjižara Beopolis se nalazi u holu Doma omladine Beograda.